밀크커피 반점은 일반적으로 색소를 완화시키는 색소레이저류로 시술을 합니다. 주로 엔디야그, 루비레이저, 색소 IPL류 등으로 치료를 시도하고 있습니다. 이들 레이저는 표피쪽의 색소에 반응하여 딱지가 생긴 후 7-14일에 거쳐 딱지가 벗겨지면 어느정도 반점의 색이 옅어집니다.
색소 레이저에 잘반응하지 않는 매우 흐린 밀크커피 반점의 경우 점에 준해 깍아내는 치료를 하는 경우도 있습니다. 이경우 레이저 후 자국이 오래가고 흉터가 남을 가능성도 조금 있어 처음부터 시도하는 방법을 아니지만 치료력과 색소 상태, 환자의 의지에 따라 결정하여 비교적 좋은 결과를 얻은 예도 있습니다.